华中科技大学产业集团有限公司最早可追溯到1992年成立的华中理工大学科技开发总公司，是原华中理工大学独家投资设立的全民所有制企业。2000年12月25日，公司整体改制，由华中科技大学与同济科技集团（武汉）联合组建，并改制为以华中科技大学为出资人的国有独资资产经营公司，注册资本20410万元人民币，承担着华中科技大学所属经营性资产保值增值和科技成果转化的双重职能。
1999年7月，华工科技产业股份有限公司组建。这标志着华中科技大学科技产业开始实现从单纯的产品经营向产品经营与资本经营并重的发展战略转移。
1999年11月8日，武汉华工大学科技园发展有限公司成立，拉开了“两个运作平台，一批规模企业”建设的序幕。
1999年12月18日，华中科技大学科技园正式开工兴建。
2000年6月8日，华工科技产业股份有限公司3000万A股在深交所成功上市交易，成为华中地区第一家具有高校背景的高科技上市公司。
2000年7月，企业孵化大楼——华工科技产业大厦建成启用。
2000年9月，武汉华工创业投资有限责任公司组建。标志着多年来华中科技大学致力于构建的高校技术创新体系的构架已基本完成。
2000年11月，华中科技大学第二家股份制公司——武汉天喻信息产业股份有限公司成立。
2000年11月，华中科技大学第三家股份制公司——武汉华中数控股份有限公司成立。
2000年12月，“武汉华中科技大产业集团有限公司”成立，标志着全校科技产业经营性资产剥离等基础性工作已基本完成，为进一步理顺产权关系，调整产业结构，形成规模效益，统一协调发展，保证科技产业持续、快速发展打下了良好基础。
2000年12月， 华中科技大学产业集团组建 。这标志着以资本为纽带，按照 “产权清晰、权责明确、政企分开、管理科学”的现代企业制度建立的高科技产业群的出现。
2001年6月， 华中科技大学科技园被国家科技部、教育部正式认定为国家级大学科技园。
2001年9月10日，华中科技大学科技园基础建设全面竣工。
2001年9月11日，武汉华中数控股份有限公司迁入产业区，成为东湖高新区大学科技园率先入驻的企业。
2001年9月16日～25日，中国高新技术开发区所在市市长会议暨资本论坛在武汉举行。
2001年10月,上市公司江汉石油钻头股份有限公司入驻科技园。
2003年1月，华工科技产业股份有限公司及其下属核心企业入驻产业区。
2003年4月，湖北省第一家高校科技企业孵化器——武汉华工科技企业孵化器成立。截至9月，在校园周边建成18，000平方米的孵化区，与华中科技大学科技园产业区相互呼应，标志着“一园两区”规划格局的完成。
2003年10月，第二届全国大学科技园会议在武汉召开，与会代表参观了华中科技大学科技园产业区和孵化区。教育部部长周济和科技部部长徐冠华到华中科技大学产业指导工作 。
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